而对于保守治疗不奏效的重症抑郁患者，药物治疗和物理治疗、认知行为治疗便必不可少了。尽管抗抑郁的药物的研究一直在进行，但是耐药性和服药依从性一直是有待解决的问题，而且对于产后需要哺乳的妈妈来说，药物服用需慎之又慎。

近年来，干细胞在治疗脑瘫、脊髓损伤、脑外伤等神经系统疾病中获得了初步的成功，证实干细胞可以在一定程度上改善和修复神经系统的结构和功能，也为利用干细胞治疗抑郁症提供了理论依据。

研究表明，海马脑区的神经元再生减少和增多是导致抑郁症发生和恢复的主要因素。

2020年，据《中国生物制品学杂志》刊登的《干细胞在治疗抑郁症中的作用》一文显示：干细胞移植的治疗方式在脑疾病中有潜在的抗抑郁作用。

研究者认为：已发现患有严重抑郁患者的海马体较小，且抑郁症患者的某些脑区神经细胞总体积较正常人减少。而干细胞可诱导分化为宿主所需的细胞，因此利用干细胞的可塑性诱导新细胞生成，再运输至细胞死亡或丧失其生理功能的特定区域以逆转这一状态，可从根本上改善疾病的进展。

2014年，《中国科学报》报道称，情绪低落会导致血清素下降，引起干细胞功能受损，从而使得细胞的正常修复和再生受到抑制，影响身体免疫功能。这是科学家首次证实了人类情绪与干细胞间的联系。同时，也为治疗抑郁症等情绪性疾病提供了新的策略。